{"id":20873,"date":"2023-09-08T10:10:03","date_gmt":"2023-09-08T10:10:03","guid":{"rendered":"https:\/\/dekkbi.com\/?p=20873"},"modified":"2023-09-08T10:10:04","modified_gmt":"2023-09-08T10:10:04","slug":"ces-especes-detruisent-systematiquement-une-grande-partie-de-leur-adn","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/dekkbi.com\/?p=20873","title":{"rendered":"Ces esp\u00e8ces d\u00e9truisent syst\u00e9matiquement une grande partie de leur ADN"},"content":{"rendered":"\n

Certaines esp\u00e8ces animales d\u00e9truisent syst\u00e9matiquement une partie de leur ADN dans leurs cellules somatiques. Pourquoi ? Comment ? Cette \u00e9limination programm\u00e9e du g\u00e9nome, d\u00e9couverte il y a 150 ans reste myst\u00e9rieuse faute de moyen d’\u00e9tudes adapt\u00e9. Un article \u00e0 paraitre dans la revue\u00a0Current Biology<\/em>\u00a0d\u00e9crit un groupe d’esp\u00e8ces de n\u00e9matodes, manipulables g\u00e9n\u00e9tiquement, pour lesquelles pr\u00e8s d’un tiers du\u00a0g\u00e9nome\u00a0est \u00e9limin\u00e9, offrant enfin un mod\u00e8le d’\u00e9tude de ce processus fascinant.<\/p>\n\n\n\n

Alors que dans la majorit\u00e9 des esp\u00e8ces, des m\u00e9canismes sophistiqu\u00e9s de protection et de maintenance de l’ADN existent, certaines esp\u00e8ces excisent et \u00e9liminent syst\u00e9matiquement des portions enti\u00e8res de leur ADN dans certaines de leurs cellules. Les cellules transmises \u00e0 la g\u00e9n\u00e9ration suivante, appel\u00e9e cellules germinales (spermatozo\u00efdes et ovules), gardent un g\u00e9nome intact. Les autres cellules, dites somatiques, subissent cette \u00e9limination programm\u00e9e du g\u00e9nome (appel\u00e9e PDE en anglais pour Programmed-DNA Elimination).<\/p>\n\n\n\n

Ce ph\u00e9nom\u00e8ne d’\u00e9limination programm\u00e9e a \u00e9t\u00e9 d\u00e9crit la premi\u00e8re fois il y a plus de 150 ans, et a depuis \u00e9t\u00e9 retrouv\u00e9 dans une centaine d’esp\u00e8ces animales, appartenant \u00e0 des embranchements tr\u00e8s diff\u00e9rents (notamment des vert\u00e9br\u00e9s comme la lamproie). C’est donc un processus qui est apparu plusieurs fois au cours de l’\u00e9volution. Pourtant, il reste \u00e0 ce\u00a0jour\u00a0myst\u00e9rieux car les esp\u00e8ces le subissant ne sont pas modifiables g\u00e9n\u00e9tiquement, ne permettant pas d’exp\u00e9rimentation\u00a0en laboratoire. Ainsi, la communaut\u00e9\u00a0scientifique\u00a0ignore encore comment l’ADN cibl\u00e9 est reconnu,\u00a0coup\u00e9, \u00f4t\u00e9 des chromosomes puis d\u00e9truit physiquement, des interrogations subsistent quant au r\u00f4le d’un tel m\u00e9canisme et pourquoi certaines esp\u00e8ces le subissent et pas d’autres.<\/p>\n\n\n\n

Ce ph\u00e9nom\u00e8ne d’\u00e9limination programm\u00e9e du g\u00e9nome a r\u00e9cemment \u00e9t\u00e9 retrouv\u00e9 dans toutes les esp\u00e8ces de n\u00e9matodes du genre\u00a0Mesorhabditis<\/em>\u00a0(appartement \u00e0 la m\u00eame famille que l’esp\u00e8ce\u00a0mod\u00e8le\u00a0Caenorhabditis elegans<\/em>). Les scientifiques, dans cet article publi\u00e9 dans la revue\u00a0Current Biology<\/em>, ont alors profit\u00e9 des nombreux avantages exp\u00e9rimentaux offrant ce mod\u00e8le pour d\u00e9crire les m\u00e9canismes d’\u00e9limination du g\u00e9nome.<\/p>\n\n\n\n

Par une combinaison d’approches cytologiques et g\u00e9nomiques, ils ont montr\u00e9 que l’\u00e9limination s’op\u00e8re par une premi\u00e8re\u00a0phase\u00a0de fragmentation des chromosomes et de l’exclusion de certains fragments pendant la\u00a0division\u00a0cellulaire dans les cellules pr\u00e9curseurs somatiques d\u00e8s le d\u00e9but du d\u00e9veloppement embryonnaire, au\u00a0stade\u00a0o\u00f9 l’embryon\u00a0n’a encore que 5 cellules. Les fragments exclus, puis d\u00e9truits, contiennent principalement des s\u00e9quences r\u00e9p\u00e9t\u00e9es non codantes, mais \u00e9galement une petite centaine de g\u00e8nes codants pour des prot\u00e9ines. Au\u00a0total, c’est environ 30% du g\u00e9nome qui est \u00e9limin\u00e9 des cellules somatiques de ces esp\u00e8ces.<\/p>\n\n\n\n

De mani\u00e8re inattendue, les scientifiques ont montr\u00e9 que deux esp\u00e8ces proches de\u00a0Mesorhabditis<\/em>\u00a0n’\u00e9liminent pas les m\u00eames s\u00e9quences r\u00e9p\u00e9t\u00e9es et n’\u00e9liminent pas les m\u00eames g\u00e8nes. Les g\u00e8nes \u00e9limin\u00e9s dans ces esp\u00e8ces sont en g\u00e9n\u00e9ral tr\u00e8s peu conserv\u00e9s au cours de l’\u00e9volution, sugg\u00e9rant qu’ils n’ont pas de r\u00f4le essentiel pour le bon fonctionnement des cellules et pour le d\u00e9veloppement embryonnaire. Ces r\u00e9sultats nous am\u00e8nent \u00e0 proposer que l’\u00e9limination programm\u00e9e du g\u00e9nome a pour fonction principale d’\u00e9liminer des \u00e9l\u00e9ments r\u00e9p\u00e9t\u00e9s et que lorsque des g\u00e8nes sont \u00e9limin\u00e9s, seuls les g\u00e8nes invisibles \u00e0 la s\u00e9lection, car inutiles dans le soma, peuvent \u00eatre \u00e9limin\u00e9s.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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